MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 49366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015697	CTA	2	6	7	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202360
2	NC_015697	ACT	2	6	21	26	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202360
3	NC_015697	AGA	2	6	53	58	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202360
4	NC_015697	TGA	2	6	64	69	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202360
5	NC_015697	ATC	2	6	130	135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202360
6	NC_015697	TAA	2	6	143	148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202360
7	NC_015697	TCG	2	6	179	184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202360
8	NC_015697	TAC	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202360
9	NC_015697	GTC	3	9	280	288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202360
10	NC_015697	TAT	2	6	294	299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202360
11	NC_015697	GAC	2	6	351	356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202360
12	NC_015697	TTAT	2	8	379	386	25 %	75 %	0 %	0 %	338202360
13	NC_015697	AATG	2	8	401	408	50 %	25 %	25 %	0 %	338202360
14	NC_015697	CAT	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202360
15	NC_015697	TAG	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202360
16	NC_015697	AAT	2	6	1082	1087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202360
17	NC_015697	TAT	2	6	1099	1104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202360
18	NC_015697	TAAT	2	8	1150	1157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015697	A	7	7	1207	1213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015697	AAG	2	6	1219	1224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015697	ATA	2	6	1416	1421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015697	CCA	2	6	1462	1467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015697	ACT	2	6	1493	1498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015697	AT	3	6	1589	1594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015697	ATT	2	6	1613	1618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015697	TTA	2	6	1637	1642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015697	ATA	2	6	1643	1648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015697	T	7	7	1676	1682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015697	T	6	6	1685	1690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015697	TAT	3	9	1706	1714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015697	A	6	6	1746	1751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015697	CA	4	8	1860	1867	50 %	0 %	0 %	50 %	338202361
33	NC_015697	TCT	2	6	1892	1897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202361
34	NC_015697	CTTG	2	8	1910	1917	0 %	50 %	25 %	25 %	338202361
35	NC_015697	TCA	2	6	1934	1939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202361
36	NC_015697	CAG	2	6	1980	1985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202361
37	NC_015697	CATTA	2	10	2071	2080	40 %	40 %	0 %	20 %	338202361
38	NC_015697	ATT	2	6	2137	2142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202361
39	NC_015697	TTC	2	6	2254	2259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202361
40	NC_015697	TCA	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202361
41	NC_015697	AATT	2	8	2368	2375	50 %	50 %	0 %	0 %	338202361
42	NC_015697	TCA	2	6	2381	2386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202361
43	NC_015697	CTA	2	6	2388	2393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202361
44	NC_015697	T	7	7	2406	2412	0 %	100 %	0 %	0 %	338202361
45	NC_015697	CAT	2	6	2461	2466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202361
46	NC_015697	TTA	2	6	2495	2500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202361
47	NC_015697	AAC	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202361
48	NC_015697	T	6	6	2522	2527	0 %	100 %	0 %	0 %	338202361
49	NC_015697	AT	3	6	2535	2540	50 %	50 %	0 %	0 %	338202361
50	NC_015697	TCC	2	6	2552	2557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015697	T	7	7	2576	2582	0 %	100 %	0 %	0 %	338202362
52	NC_015697	GTTT	2	8	2620	2627	0 %	75 %	25 %	0 %	338202362
53	NC_015697	AAT	2	6	2690	2695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202362
54	NC_015697	TAA	2	6	2717	2722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202362
55	NC_015697	ATG	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202362
56	NC_015697	CCT	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338202362
57	NC_015697	ATAA	2	8	2894	2901	75 %	25 %	0 %	0 %	338202362
58	NC_015697	TTC	2	6	2972	2977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202362
59	NC_015697	GCT	2	6	3042	3047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202362
60	NC_015697	TTAA	2	8	3051	3058	50 %	50 %	0 %	0 %	338202362
61	NC_015697	TGT	2	6	3122	3127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202362
62	NC_015697	GGT	2	6	3140	3145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202362
63	NC_015697	TGCT	2	8	3158	3165	0 %	50 %	25 %	25 %	338202362
64	NC_015697	CCA	2	6	3183	3188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202362
65	NC_015697	ATC	2	6	3200	3205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202362
66	NC_015697	CAA	2	6	3232	3237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202362
67	NC_015697	AAT	2	6	3257	3262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202362
68	NC_015697	TTCA	2	8	3326	3333	25 %	50 %	0 %	25 %	338202362
69	NC_015697	AGC	2	6	3367	3372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202363
70	NC_015697	T	7	7	3373	3379	0 %	100 %	0 %	0 %	338202363
71	NC_015697	ATG	2	6	3414	3419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202363
72	NC_015697	CAA	2	6	3500	3505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202363
73	NC_015697	AAT	2	6	3525	3530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202363
74	NC_015697	CCA	2	6	3562	3567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202363
75	NC_015697	GTT	2	6	3568	3573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202363
76	NC_015697	GCA	2	6	3607	3612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202363
77	NC_015697	CTT	2	6	3668	3673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202363
78	NC_015697	AAT	2	6	3700	3705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202363
79	NC_015697	ACT	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202363
80	NC_015697	ATA	2	6	3784	3789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202363
81	NC_015697	T	6	6	3893	3898	0 %	100 %	0 %	0 %	338202363
82	NC_015697	CTA	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202363
83	NC_015697	TGA	2	6	4063	4068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202363
84	NC_015697	TCA	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202363
85	NC_015697	TAT	2	6	4151	4156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202363
86	NC_015697	AAG	2	6	4203	4208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202364
87	NC_015697	GTT	2	6	4224	4229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202364
88	NC_015697	CATTT	2	10	4310	4319	20 %	60 %	0 %	20 %	338202364
89	NC_015697	T	6	6	4333	4338	0 %	100 %	0 %	0 %	338202364
90	NC_015697	CTT	2	6	4345	4350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202364
91	NC_015697	ATA	2	6	4394	4399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202364
92	NC_015697	TAAT	2	8	4473	4480	50 %	50 %	0 %	0 %	338202364
93	NC_015697	TAT	2	6	4732	4737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202364
94	NC_015697	T	6	6	4782	4787	0 %	100 %	0 %	0 %	338202364
95	NC_015697	TCAA	2	8	4824	4831	50 %	25 %	0 %	25 %	338202364
96	NC_015697	GAAA	2	8	4870	4877	75 %	0 %	25 %	0 %	338202364
97	NC_015697	TCA	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202364
98	NC_015697	TCG	2	6	5033	5038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202364
99	NC_015697	CCA	3	9	5052	5060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202364
100	NC_015697	GCT	2	6	5064	5069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202364
101	NC_015697	T	6	6	5168	5173	0 %	100 %	0 %	0 %	338202364
102	NC_015697	TTC	2	6	5252	5257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202364
103	NC_015697	AAAGCC	2	12	5291	5302	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338202364
104	NC_015697	GGAT	2	8	5304	5311	25 %	25 %	50 %	0 %	338202364
105	NC_015697	AGC	2	6	5333	5338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202364
106	NC_015697	ATAG	2	8	5447	5454	50 %	25 %	25 %	0 %	338202364
107	NC_015697	TAT	2	6	5489	5494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202364
108	NC_015697	CAC	2	6	5509	5514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202364
109	NC_015697	ACC	2	6	5546	5551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202365
110	NC_015697	T	6	6	5587	5592	0 %	100 %	0 %	0 %	338202365
111	NC_015697	ACT	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202365
112	NC_015697	CTG	2	6	5700	5705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202365
113	NC_015697	CCA	2	6	5714	5719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202365
114	NC_015697	CTT	2	6	5745	5750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202365
115	NC_015697	AG	3	6	5757	5762	50 %	0 %	50 %	0 %	338202365
116	NC_015697	CAA	2	6	5790	5795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202365
117	NC_015697	CTT	2	6	5881	5886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202365
118	NC_015697	TCA	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202365
119	NC_015697	AGGA	2	8	5938	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	338202365
120	NC_015697	T	6	6	5946	5951	0 %	100 %	0 %	0 %	338202365
121	NC_015697	TTA	2	6	5975	5980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202365
122	NC_015697	TCC	2	6	5994	5999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338202366
123	NC_015697	GTT	2	6	6016	6021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202366
124	NC_015697	TTC	2	6	6035	6040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202366
125	NC_015697	TCA	2	6	6094	6099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202366
126	NC_015697	CA	3	6	6116	6121	50 %	0 %	0 %	50 %	338202366
127	NC_015697	AAC	2	6	6122	6127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202366
128	NC_015697	T	6	6	6135	6140	0 %	100 %	0 %	0 %	338202366
129	NC_015697	GTTG	2	8	6180	6187	0 %	50 %	50 %	0 %	338202366
130	NC_015697	T	6	6	6254	6259	0 %	100 %	0 %	0 %	338202366
131	NC_015697	T	6	6	6283	6288	0 %	100 %	0 %	0 %	338202366
132	NC_015697	GTT	2	6	6291	6296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202366
133	NC_015697	ATTT	2	8	6359	6366	25 %	75 %	0 %	0 %	338202366
134	NC_015697	AGAT	2	8	6430	6437	50 %	25 %	25 %	0 %	338202366
135	NC_015697	ACC	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202367
136	NC_015697	AAC	2	6	6574	6579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202367
137	NC_015697	ACT	2	6	6615	6620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202367
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249	NC_015697	T	7	7	11761	11767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_015697	TAT	2	6	11788	11793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_015697	TAAT	2	8	11844	11851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_015697	AAT	2	6	11865	11870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_015697	TAC	2	6	12282	12287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202374
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267	NC_015697	AAT	2	6	12385	12390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202374
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